马洪雨  教授 博士生导师

一、基本情况

马洪雨，1979年生，山东招远人，博士，教授，博士生导师，汕头大学-马来西亚登嘉楼大学虾蟹贝类联合实验室中方主任、广东省海洋生物技术重点实验室常务副主任。受聘为马来西亚登嘉楼大学访问教授（2019.11-2021.10）和博士生导师。兼任中国水产学会第十届理事会水产生物技术专业委员会委员、中国青年科技工作者协会第六届理事会理事、中国青蟹产业技术创新平台副主席、广东水产种业创新联盟首届专家委员会委员、广东省遗传学会第十届理事会理事、汕头市青年科技工作者协会第八届副会长、汕头市青年联合会常务委员等。为本科生、硕士生和博士生讲授《遗传与育种学》、《动物学》、《海洋动物分子生物学》等课程。

主要从事海洋生物技术与遗传育种研究，在青蟹苗种繁育与发育机制、养殖与品种选育、性别决定与分化、杂交机制及性逆转等方面取得了突出成绩。主持科研项目22项，其中国家级5项、省部级6项。以第1作者或通讯作者发表SCI论文75篇。合作出版专著5部，英文2部，副主编1部。获国家发明专利授权13项、实用新型12项、软件著作权1项。荣获上海市科技进步二等奖、中国产学研合作创新奖等科技奖励 10余项，其中省部级3项、厅局级6项。荣获科学中国人（2018）年度人物、上海市青年岗位能手、汕头市优秀共产党员等荣誉称号10余次。曾在加州理工学院生物系做访问学者一年。

二、学习和工作经历

2019.10-今，汕头大学，所长

2019.07-今，汕头大学，理学院党委委员

2016.06-今，汕头大学，教授，博导

2013.09-2014.09，加州理工学院，访问学者

2012.01-2016.04，中国水产科学研究院东海水产研究所，副研究员，硕导，党支部副书记

2009.07-2011.12，中国水产科学研究院东海水产研究所，助理研究员

2006.09-2009.06，中国海洋大学，海洋生物学，博士

2003.09-2006.07，山东农业大学，动物遗传育种与繁殖学，硕士

1999.09-2003.07，山东农业大学，水产养殖学，学士

三、人才与荣誉称号

1. 2019年06月，荣获“科学中国人（2018）年度人物”荣誉称号
2. 2019年06月，荣获“汕头市优秀共产党员”荣誉称号
3. 2019年05月，荣获汕头市优秀科技工作者荣誉称号
4. 2016年02月，荣获中国水产科学研究院“先进工作者”荣誉称号
5. 2015年04月，荣获上海市第十三届“上海市青年岗位能手”荣誉称号

四、科技奖励

1. 2020年07月，荣获上海海洋科学技术奖二等奖，锈斑蟳人工繁育与种质资源开发关键技术研究及应用（第3完成人）
2. 2018年12月，荣获2018年中国产学研合作创新奖
3. 2016年05月，荣获第二十八届上海市优秀发明选拔赛创新成果奖银奖，拟穴青蟹种质创新技术研究与应用（第1完成人）
4. 2015年11月，荣获上海市科技进步奖二等奖，拟穴青蟹人工繁育养殖与种质资源开发关键技术研究及应用（第3完成人）
5. 2015年11月，荣获海洋工程科学技术奖二等奖，拟穴青蟹种质资源开发与人工繁养关键技术研究及应用（第3完成人）
6. 2015年02月，荣获上海海洋科学技术奖二等奖，拟穴青蟹种质资源发掘及改良技术的建立与应用（第1完成人）
7. 2015年01月，荣获中国水产科学研究院科技进步奖二等奖，拟穴青蟹遗传资源深度挖掘及辅助育种技术的建立与应用（第1完成人）

五、主持项目

1. 广东省普通高校重点领域专项项目（乡村振兴），青蟹高效繁育养殖技术示范与推广，主持；（编号：2020ZDZX1001，执行期：2021.01-2023.12）
2. 国家自然科学基金面上项目，Hox基因Ubx/Abd-A在拟穴青蟹幼体腹部变态发育过程中的功能研究，主持；（编号：42076133，执行期：2021.01-2024.12）
3. 广东省促进经济发展专项资金项目（现代渔业发展用途），青蟹全人工规模化扩繁与生态养殖技术示范推广，子课题主持；（编号：粤农2019B4，执行期：2019.06-2021.06）
4. 广东省科技计划项目（国际科技合作领域），青蟹软壳蟹培育技术创新与示范推广，主持；(编号：2018A050506080，执行期：2018.12-2020.11)
5. 国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项，水产养殖生物性别和发育的分子基础与调控机制-子课题-拟穴青蟹基因组解析与性别特异SNP标记鉴定研究，主持；(编号：2018YFD0900201-3，执行期：2018.12-2022.12)
6. 广东省促进经济发展专项资金项目（现代渔业发展用途），池塘工程化循环水养殖技术的创新与应用，主持；(编号：SDYY-2018-11，执行期：2018.07-2019.06)
7. 国家自然科学基金项目，拟穴青蟹染色体性别决定机制研究，主持；(编号：31772837，执行期：2018.01-2021.12)
8. 汕头市科技计划项目，拟穴青蟹池塘生态育苗技术研究与示范推广，主持；(编号：2016-44，执行期：2017.01-2018.12)
9. 汕头大学科研启动经费项目，基于组学的拟穴青蟹性腺发育相关基因和LncRNAs鉴定与功能研究，主持；(编号：NTF17006，执行期：2017.06-2020.05)
10. 国家留学人员科技活动择优资助项目，拟穴青蟹IGFR2基因启动子区甲基化修饰及调控mRNA转录的机制研究，主持；(编号：执行期：2015.03-2017.02)
11. 上海市科技支撑项目，基于QTLs的拟穴青蟹分子辅助育种技术构建与应用，主持；(编号：15391900900，执行期：2015.07-2017.12)
12. 上海市自然科学基金项目，IGF2基因多态性及其调控拟穴青蟹生长发育的分子机制研究，主持；(编号：14ZR1449700，执行期：2014.07-2017.06)
13. 中央级科研院所基本科研业务费项目，拟穴青蟹快速生长良种选育基础群构建，主持；(编号：2011M05，执行期：2011.10-2013.09)
14. 国家自然科学基金项目，拟穴青蟹生长性状相关分子标记、QTLs发掘及定位研究，主持；(编号：31001106，执行期：2011.01-2013.12)

六、代表性论文（*，通讯作者）

1. Ardavan Farhadi, Cui Wenxiao, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. The regulatory mechanism of sexual development in decapod crustaceans. Frontiers in Marine Science, 2021, online available.
2. Zhang Yin, Fang Shaobin, Lin Fei, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Identification, characterization of gene SpDMRT99B and the sex-biased expression profile in the mud crab, Scylla paramamosain. Journal of Ocean University of China, 2021, accepted.
3. Cui Wenxiao, Yang Qin, Zhang Yin, Ardavan Farhadi, Fang Huan, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Integrative transcriptome sequencing reveals the molecular difference of maturation process of ovary and testis in mud crab Scylla paramamosain. Frontiers in Marine Science, 2021, 8: 658091.
4. Zhang Yin, Wu Qingyang*, Fang Shaobin, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. mRNA profile provides novel insights into stress adaptation in mud crab megalopa, Scylla paramamosain after salinity stress. BMC Genomics, 2020, 21: 559.
5. Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Nor Afiqah-Aleng, Julia Hwei Zhong Moh, Mhd Ikhwanuddin, Marina Hassan, Mohd Husin Norainy, Ma Hongyu*. Gonadal transcriptomic analysis of the mud crab Scylla olivacea infected with rhizocephalan parasite Sacculina beauforti. Genomics, 2020, 112 (5): 2959-2969.
6. Wang Yue, Wang Xuepeng, Zhang Bin, Li Zhimin, Yang Liguo, Li Xincang*, Ma Hongyu*. A lysin motif-containing protein (SpLysMD3) functions as a PRR involved in the antibacterial responses of mud crab, Scylla paramamosain. Fish & Shellfish Immunology, 2020, 97: 257-267.
7. Wu Qingyang, Khor Waiho, Huang Zhi, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Lin Feng, Ma Hongyu*. Growth performance and biochemical composition dynamics of ovary, hepatopancreas and muscle tissues at different ovarian maturation stages of female mud crab, Scylla paramamosain. Aquaculture, 2020, 515: 734560.
8. Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Li Shengkang, Zhang Yueling, Zheng Huaiping, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Comparative profiling of ovarian and testicular piRNAs in the mud crab Scylla paramamosain. Genomics, 2020, 112 (1): 323-331.
9. Fang Shaobin, Zhang Yin, Shi Xi, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Zhang Yueling, Hanafiah Fazhan, Khor Waiho, Tan Huaqiang, Mhd Ikhwanuddin, Hongyu Ma*. Identification of male-specific SNP markers and development of PCR-based genetic sex identification technique in crucifix crab (Charybdis feriatus) with implication of an XX/XY sex determination system. Genomics, 2020, 112 (1): 404-411.
10. Lin Jiali, Shi Xi, Fang Shaobin, Zhang Yin, You Cuihong, Ma Hongyu*, Lin Fan*. Comparative transcriptome analysis combining SMRT and NGS sequencing provides novel insights into sex differentiation and development in mud crab (Scylla paramamosain). Aquaculture, 2019, 513: 734447.
11. Wu Qingyang, Shi Xi, Fang Shaobin, Xie Zhuofang, Guan Mengyun, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Zhang Yueling, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Different biochemical composition and nutritional value attribute to salinity and rearing period in male and female mud crab Scylla paramamosain. Aquaculture, 2019, 513: 734417.
12. Khor Waiho, Shi Xi, Hanafiah Fazhan, Li Shengkang, Zhang Yueling, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Fang Shaobin, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. High-density genetic linkage maps provide novel insights into ZW/ZZ sex determination system and growth performance in mud crab (Scylla paramamosain). Frontiers in Genetics, 2019, 10: 298.
13. Khor Waiho, Hanafiah Fazhan, Zhang Yin, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Mhd Ikhwanuddin*, Ma Hongyu*. Gonadal microRNA expression profiles and their potential role in sex differentiation and gonadal maturation of mud crab Scylla paramamosain. Marine Biotechnology, 2019, 21: 320-334.
14. Shi Xi, Lu Jianxue, Wu Qingyang, Khor Waiho , Jude Juventus Aweya, Hanafiah Fazhan, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Lin Fan, You Cuihong, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Comparative analysis of growth performance between female and male mud crab Scylla paramamosain crablets: Evidences from a four-month successive growth experiment. Aquaculture, 2019, 505: 351-362.
15. Shi Xi, Khor Waiho, Li Xincang, Mhd Ikhwanuddin, Miao Guidong, Lin Fan, Zhang Yueling, Li Shengkang, Zheng Huaiping, Liu Wenhua, Jude Juventus Aweya, Ghazali Azmie, Juliana C. Baylon, Emilia T. Quinitio, Ma Hongyu*. Female-specific SNP markers provide insights into a WZ/ZZ sex determination system for mud crab Scylla paramamosain, S. tranquebarica and S. serrata with a rapid method for genetic sex identification. BMC Genomics, 2018, 19: 981.
16. Zhang Yin, Miao Guidong, Wu Qingyang, Lin Fan, You Cuihong, Wang Shuqi, Jude Juventus Aweya, Ma Hongyu*. Transcriptome sequencing and molecular markers discovery in the gonads of Portunus sanguinolentus. Scientific Data, 2018, 5: 180131.
17. Khor Waiho, Hanafiah Fazhan*, Emilia T. Quinitio, Juliana C. Baylon, Yushinta Fujaya, Ghazali Azmie, Wu Qingyang, Shi Xi, Mhd Ikhwanuddin*, Ma Hongyu*. Larval rearing of mud crab (Scylla): What lies ahead. Aquaculture, 2018, 493:37-50.
18. Zhang Yin, Miao Guidong, Hanafiah Fazhan, Khor Waiho, Zheng Huaiping, Li Shengkang, Mhd Ikhwanuddin, Ma Hongyu*. Transcriptome-seq provides insights into sex-preference pattern of gene expression between testis and ovary of the crucifix crab (Charybdis feriatus). Physiological Genomics, 2018, 50 (5): 393-405.
19. Yang Xiaolong, Ikhwanuddin Mhd, Li Xincang, Lin Fan, Wu Qingyang, Zhang Yueling, You Cuihong, Liu Wenhua, Cheng Yinwei, Shi Xi, Wang Shuqi, Ma Hongyu*. Comparative transcriptome analysis provides insights into differentially expressed genes and long non-coding RNAs between ovary and testis of the mud crab (Scylla paramamosain). Marine Biotechnology, 2018, 20 (1): 20-34.
20. 马洪雨, 吴清洋, 谭华强, 吴芳春, 林锋. 青蟹种间人工杂交技术建立及杂种子一代表型和遗传特征鉴定. 汕头大学学报（自然科学版）, 2021, 已录用.
21. 马洪雨, 吴清洋, 林锋, 张建生, 石西, 邱丽华, 范嗣刚. 拟穴青蟹室内水泥池高效人工育苗技术研究. 科学养鱼, 2021, 2: 65-66.
22. 吴清洋, 林锋, 石西, 张建生, 邱丽华, 范嗣刚, 马洪雨*. 拟穴青蟹池塘生态高效养殖技术研究. 科学养鱼, 2020, 7: 62-63.
23. 马洪雨, 谭华强, 方少彬, 黄智, 沈卓辉, 沈卓坤, 张建生, 张健彬, 林锋, 吴清洋, Mhd Ikhwanuddin. 青蟹陆基高密度循环水养殖技术的建立与应用. 科学养鱼, 2019, 12: 61-63.
24. 马洪雨, 吴清洋, 石西, 张建生, 陆建学, 夏连军. 拟穴青蟹池塘生态育苗技术研究. 科学养鱼, 2019, 2: 12-13.

八、代表性著作

1. Ma Hongyu, Chen Songlin, Ji Xiangshan. 2018. Sex-specific markers, gynogenesis and sex control in spotted halibut. Chapter in Book “Sex Control in Aquaculture” edited by Wang, H.P., F. Piferrer & S.L. Chen. ISBN 978-1-119-12726-0. Wiley-Blackwell.
2. Ma Hongyu et al., Microsatellite markers in the mud crab (Scylla paramamosain) and their application in population genetics and marker-assisted selection. Chapter 9 in Book “Microsatellite Markers”, edited by Ibrokhim Y. Abdurakhmonov, ISBN 978-953-51-4870-8. Published by InTech Open, 2016.11.30.
3. 副主编, 水产微生态制剂和消毒剂使用手册, ISBN号为978-7-5082-9801-6, 2015年1月由金盾出版社出版.
4. 编者, 鱼类性别控制与细胞工程育种, ISBN号为978-7-03-036707-5, 2013年3月由科学出版社出版.

九、联系方式

广东省汕头市金平区大学路243号汕头大学海洋生物研究所。电话: 0754-86503471 (办); E-mail: mahy@stu.edu.cn